В 1944 году возникла необходимость в ночных истребителях для обороны метрополии от налетов В-29. Для этих целей был создан на базе разведчика C6N Saiun ночной истребитель C6N1-S с экипажем из двух человек, вооруженный парой 20-мм пушек, установленных в фюзеляже под углом к горизонту. Благодаря сокращению экипажа, снятию части оборудования и оборонительного пулемета удалось сохранить при этом высокие летные данные самолета. Saiun стал самым скоростным японским ночным истребителем, но эффективность его применения ограничивалась отсутствием поискового локатора. Реально было оборудовано только несколько таких истребителей.

Модификация	C6N1-S
Размах крыла, м	12.50
Длина, м	11.00
Высота, м	3.96
Площадь крыла, м2	22.50
Масса, кг
пустого самолета	3000
максимальная взлетная	5262
Тип двигателя	1 ПД Nakajima NK9H Homare-21
Мощность, л.с.	1 х 1900
Максимальная скорость , км/ч	610
Крейсерская скорость , км/ч	389
Практическая дальность, км	3080
Максимальная скороподъемность, м/мин	846
Практический потолок, м	10740
Экипаж	2
Вооружение:	две 20-мм пушки Ho-5