Hезадолго до начала высотных дневных рейдов на Японию, бомбаpдиpовщиков B-29 из американского XX-го Бомбардировочного командования, Главный штаб JAAF стал настойчиво требовать создания истpебителя-перехватчика с хорошими летными данными на большой высоте. Армейский научно-исследовательский авиационный институт (Rikugun Kokugijutsu Kenkyujo) в Тачикаве в июне 1943 исследовал возможность применения Ki-46-III, который был одним из немногих боевых самолетов JAAF, имевших необходимые высотные данные для этого типа операций. В мае 1944 проект был срочно воскрешен и в 1-м армейском авиационном арсенале в Тачикаве (Tachikawa Dai-ichi Rikugun Kokosho) быстро созданы переделочные линии.

Фотоаппаратура и передний фюзеляжный бак были заменены двумя 20-мм пушками Ho-5 с боекомплектом по 200 снарядов на ствол, кабина модифицирована по типу Ki-46-II,а 37-мм пушка Ho-203 с боекомплектом в 200 снарядов установленная в центре фюзеляжа,стреляла вперед-вверх (аналогично немецкой установке "Shrage Musik") под углом 30 градусов. Первый самолет этого типа, известный как аpмейский истpебитель ПВО Тип 100 (Ki-46-III KAI),был собран в октябре 1944 года. С ноября этого года самолет этого типа служил в ПВО Японии,состоя на вооpужении двух сентаев, пяти отдельных эскадpилий и одного учебного отряда. Однако самолет оказался не очень удачным, так как был слишком уязвимым от сосредоточенного огня B-29 и не имел скороподьемности, требуемой от перехватчика.

В марте 1945 на "Mitsubishi" было начато создание двух дополнительных истpебительных вариантов без 37-мм пушки. Это были Ki-46-IIIb или аpмейский штурмовик Тип 100, которого выпустили лишь в нескольких экземлярах, и Ki-46-IIIa с наклонно установленными 20-мм пушками Ho-5,оставшийся на чертежных досках.

Модификация	Ki-46-III KAI
Размах крыла, м	14.70
Длина, м	11.00
Высота, м	3.88
Площадь крыла, м2	32.03
Масса, кг
пустого самолета	3831
нормальная взлетная	6228
Тип двигателя	2 ПД Mitsubishi Ha-112-II
Мощность, л.с.	2 х 1500
Максимальная скорость , км/ч	629
Крейсерская скорость , км/ч	425
Практическая дальность, км	2000
Максимальная скороподъемность, м/мин	450
Практический потолок, м	10500
Экипаж	2
Вооружение:	две 20-мм пушки и одна 37-мм пушка